إدارة وكيل الشؤون العلمية بالجامعة تقوم بالإشراف على العمل الأكاديمي بكافة أشكاله المتمثلة في ضبط جودة المناهج وتأهيل وترقية أعضاء هيئة التدريس كلا في مجال تخصصه ووضع سياسات قبول طلاب الدراسات العليا والمعيدين وتسجيلهم وحفظ السجلات الأكاديمية ويعتبر وكيل الجامعة للشؤون العلمية أحد أعضاء هيئة التدريس بالجامعة بحيث يتم تعيينه من قبل وزير التعليم العالي لشغل هذا المنصب،ويعمل تحت الإشراف المباشر للسيد رئيس الجامعة ومن المهام المتميزة للشؤون العلمية مراقبة برنامج الدراسة والامتحانات والتأكد من إجراءتها وفق اللوائح المعمول بها ومتابعة إجراءات الدراسات العليا وتوفير فرص التدريب لأعضاء هيئة التدريس والموظفين وتسهيل إجراءات مشاركتهم في المؤتمرات العلمية وورش العمل والندوات العلمية وفق الضوابط واللوائح المعمول بها ويكون مسؤولاً على تجويد وتحسين العمل الأكاديمي بالجامعة ، ويعتبر رئيساً لمجلس الدراسات العليا ولمجلس الجودة والاعتماد والمشرف العام للجنة شؤون أعضاء هيئة التدريس وكذلك لمجلس المجلات العلمية بكليات الجامعة ومقرر لجان مراجعة وإجازة اللوائح الأكاديمية وأيضا مقرراً للجان إنشاء الأقسام والوحدات العلمية التابعة للجامعة. كما أن الإدارات التالية تتبع لوكيل الجامعة للشؤون العلمية وتعمل تحت إشرافه مباشرة.