تأسيس الجــامـــعة في رحاب زاوية الشيخ عبدالسلام الأسمر بمدينـة زليـتن، كـان مـيلاد الجامعـة الأسـمرية الإسلامية ، ولم يكن هذا وليد الصدفة وإنما هو تقدير للدور الحضاري والعلمي الذي قامت به هذه الزاوية في مجتمعنا الليبي. ولاشك أن امتداد الإرث التاريخي لمؤسسة تربوية لما يزيد عن خمسة قرون يعد عنصراً مهمـاً فـي مسـيرتها ؛ ليس محفزاً لعملية التحول والتطور فحسب، بل يسرَّع الخطى نحو تحقيق  الهدف المنشود من إنشاء الجامعة؛ إذ نجد ذلك في نشأة الجامعة بالقرار  رقم (257) لسنة (1415 هـ – 1996م) الصادر عن مجلس الوزراء ( اللجنة الشـعبية العامة سابقا) بإنشاء الجامعة الأسمرية للعلوم الإسلامية، فقد تضمن نص القرار “تنشأ وفقاً لأحكام هذا القرار مؤسسة علمية تسمى الجامعة الأسمرية للعلوم الإسلامية تكون لها الشخصية الاعتبارية والذمة المالية المستقلة وتتبع وزارة التعليم (اللجنة الشعبية العامـة للتعلـيم والبحـث العلمـي سـابقاً) “، تُعنـى بالتعليم الديني وإحياء التراث الإسلامي في إطار التعليم الجامعي. كما تشرف على التعليم الـديني فـي المنارات الدينية وثانويات العلوم الشرعية.  وجاء تعديل تسمية الجامعة الأسمرية للعلوم الإسلامية وفق قرار مجلس الـوزراء رقـم (444) لسنة 2013 م الصادر بتاريخ 29 رمضان، 1434 هـ الموافق (2013/8/7 م) “بتقرير بعـض الأحكـام في شأن الجامعة الأسمرية للعلوم الإسلامية ” الذي تضمن ” تعديل تسمية الجامعة الأسمرية للعلـوم الإسلامية لتصبح  (الجامعة الأسمرية الإسلامية)، وتنقل تبعية الكليات العلمية الموجودة بمدينـة زليتن التابعة لجامعة المرقب إلى الجامعة الأسمرية الإسلامية كما نص القرار على جواز استحداث كليات جديدة تابعة للجامعة وفقاً للاحتياجات .